AR-GE Başkanlığı, bilimsel ve kültürel projelerle Türk-İslam medeniyetini geleceğe taşıyan yenilikçi çözümler üretir.

Dış İlişkiler Başkanlığı, Türk ve İslam coğrafyasında yer alan devletler, kültürel kurumlar ve uluslararası kuruluşlarla stratejik iş birlikleri geliştirmeyi amaçlayan birimdir.

Eğitim ve Akademik Faaliyetler Başkanlığı, eğitim ve akademik faaliyetleri temsil eden birimdir.

Finans ve Mali İşler Başkanlığı, derneğin tüm mali süreçlerini şeffaf, sürdürülebilir ve hesap verebilir bir anlayışla yöneten temel birimdir.

Gençlik Kolları Başkanlığı, köklerinden ilham alan ve geleceğe yön veren birimdir.

Genel Sekreterlik, derneğin idari düzenini sağlayan, birimler arası koordinasyonu yöneten ve karar süreçlerini ilerleten birimdir.